文献精读 栏目介绍
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前言

随着博客平台的稳定和RSS的使用越来越得心应手,我总算要回归初心,即将个人博客作为一个长期的自主性文献阅读与整理的平台。诚然,文献阅读也有一些本地方案,但我认为个人博客还是有不少优势的:

  • 出于更新目的,主动阅读文献;
  • 出于展示目的,自我要求更严格,暗合费曼学习法,更容易自我提高;
  • 跨文章分类和搜索功能:博客对文章内容有搜索功能;
  • 无限的社区互动潜力:我来划水,新手看热闹,大佬给意见;
  • 归档管理:利用WordPress的归档页面进行文献总结的编年史;
  • 基于Markdown,可支持的资料和笔记的类型更加丰富

本文主要是简单地介绍我关于在个人博客上阅读文献的想法和计划。如果你觉得很有趣,并且也想拥有个人博客,可以看我博客的《学习地图》的“WordPress系列”了解详情(有这种逆天教程,还要什么自行车?)。此外,我会开一个文献精读系列记录自己精读文献的笔记,主要是生物医学领域(分子生物学和临床研究居多)。在敦促自己看文献的同时也给有需要的小伙伴们康康,也欢迎大佬们批评指正!

文献跟踪

我在《解决信息爆炸困扰的完美方案——RSS》一文中也提过,RSS是一种对科研人员十分友好的信息获取方式,可以完美地对多种来源的文献进行分类和整合。RSS阅读器里的更新频率设置30分钟/次就差不多了,基本上不会遗漏新的文献。我个人建议的文献跟踪方式有以下几种:

主题RSS

最常用的策略之一,也可以称为“关键词RSS”。比如,如果你想了解生物医学领域前沿,可以通过MeSH数据库构建关键词组合,然后在PubMed里灵活运用OR/AND/NOT等逻辑符,即可创建针对性很强的搜索项的RSS。而且,通过ISSN号,你还可以限定杂志的影响因子范围,或者根据同行的建议选择领域内地位较高的杂志,从而在文献来源上对文献条目进行初步优化。Google Scholar也是类似的,可以利用Google Alerts产生RSS源。虽然其它领域没了解过,但一般而言,学术界的搜索引擎对RSS还是很友好的。对于你的某个具体的课题,可能有一些局限的搜索项。将它们添加到RSS,也可以及时追踪到最新进展。很方便!

作者RSS

如果你的感兴趣领域有一些比较优秀的作者(一般是第一作者或者是通讯作者),并且你想长期持续地追踪他们的工作,也可以通过RSS跟踪他们的工作。在PubMed上,可以利用作者的ID进行限定。某些比较出名的学者也会有自己的blog,直接RSS订阅,简直不要太方便!

文献阅读

笔记

如果有了稳定的文献RSS源,接下来肯定是要读文献了。根据我的经验,读文献最好做一下笔记。正所谓:“好记性不如烂笔头”。文献笔记有助于“温故而知新”。我注意到,很多小伙伴喜欢直接在PDF里进行记录,不过我个人不太喜欢,理由如下:

  • PDF的空间小,笔记比较零散
  • PDF互相独立,笔记很难统一管理(比如搜索)
  • 不适合高级笔记结构(比如流程图、外链、内链之类的)和格式
  • 难以向他人分享

也许,MarkdownNotion语雀之类的方式更合适。当然,怎么记笔记主要是个人习惯,我并没有强烈推荐一种。在文献精读时,我一般是顺着文献框架进行分解和阅读,这样看上去比较有条理。总之,以方便回顾为原则吧,如果记忆力好或者专业基础浓厚,只做一点点笔记甚至不做笔记估计问题也不大。但一般不推荐新手在看文献时不做笔记

类型

通常,文献阅读都是多多益善。不过,“多读文献对科研有好处”和“吃饭有益身心健康”的是类似的,虽然没有错误,但没有建设性。根据我的观察,按文献阅读目的的不同,文献阅读可分为以下类型:

  • 快读:主要阅读文献的标题和摘要,偶尔还会阅读正文/图片的小标题。以了解新发现或新观点为主要目的。受限于个人的时间和精力,RSS推送文献中的绝大部分阅读方式只能是快读。一来,快读有助于培养“直觉”,即判断某个东西是否重要或者有前途;二来,快读文献往往是精读文献或专读文献的储备库。
  • 精读:在快读文献的过程中,筛选出少数与兴趣、课题或未来计划较贴合的文献更深入地阅读。以了解研究者的课题/实验设计逻辑为主要目的。通常会仔细地阅读文献的Results部分(也不是说其它部分不重要,只是说相对次要),对研究过程等进行拆解和复盘,最终形成逻辑闭环。一般,新技术、作者论证过程中的混杂因素控制策略往往是精读文献的主要障碍,特别是分子生物学顶级期刊里的论文。最后,精读要好好做笔记,以便反复咀嚼文献的精华所在。
  • 专读:计划性和针对性较强。一般与读者的课题开展密切相关,比如学习并运用文献框架、新技术或新实验等;往往需要与同事讨论和印证,结合现实中的经验。类似于精读,专读更要好好做笔记,对文献的细节也要滚瓜烂熟。

简而言之,快读大部分文献、精读少部分文献、专读无上限。坚持长期、有策略地阅读和总结,再搭配好的基础教材,慢慢就可以培养出完整的研究框架和敏锐的研究直觉(I guess)。

另外,文献阅读也存在二八定律,即约20%的文献对你的知识体系贡献率可高达约80%。这意味着某些文献的阅读可能是无效的,这为在较短时间内追求较高阅读质量提供了可能性。如果你阅读文献的时间很少,那么只阅读少数质量较高的文献是个不错的选择。控制影响因子、杂志或作者是个不错的开始。

小结

作为科研工作者,搭建一个科学的文献阅读框架十分重要。21世纪是一个知识爆发式增长的时代,坚持科学的阅读将有助于我们保持开阔的视野和开放的心态。希望可以和大家共同进步!

扩展阅读

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